بررسی ژنومیکس تغییرات توالی ۵/-utr ژن f ویروس سرخک سوش واکسن aik-c تکثیر شده در سلول های mrc-۵

زمینه: در انتهای5 /-utr ژن f سویه واکسن سرخک یک توالی غیر معمول طولانی غیرکد کننده قرار دارد که با توجه به موتاسیون ها و حذف های منطقه ای، تغییرات در این ناحیه می تواند بر عملکرد پروتئین f تولید شده مؤثر باشد. هدف: مطالعه به منظور تعیین ژنومیکس تغییرات توالی 5/-utr ژن f ویروس سرخک سوش واکسن aik-c تکثیر شده در سلول های mrc-5 انجام شد. مواد و روش ها: این پژوهش بنیادی در سال 1385 در بخش بیوتکنولوژی مؤسسه سرم و واکسن سازی رازی انجام شد. پس از کلون سازی و تکثیر با روشrt-pcr و سپس ترادف یابی توالی ناحیه5 /-utr ژن کد کننده پروتئین f، تغییرات ژنتیکی ایجاد شده در توالی سویه واکسن مورد مطالعه با توالی سویه های واکسن استاندارد موری و پارکز موجود در بانک اطلاعات ژن با استفاده از برنامه dnaman مقایسه شد. یافته ها: از مقایسه نتایج حاصل از تعیین توالی ناحیه5 /-utr ژن کد کننده پروتئین f سویه واکسن مورد مطالعه با دو توالی مرجع مشخص شد که ناحیه غیر کد کننده پروتئین فیوژن سویه واکسنی سرخک aik-c با تغییر کشت سلولی از فیبروبلاست جوجه به mrc-5، در نوکلئوتید شماره 156 و در نوکلئوتید 288 دچار تغییرشده است. نتیجه گیری: با توجه به اهمیت مشاهده تغییر در ناحیه در انتخاب کدون aug ابتدایی ژن کد کننده پروتئین فیوژن و نقش آن درمیزان بیان این پروتئین، این احتمال وجود دارد که تغییر در نوع کشت سلول ویروس سرخک بتواند در شرایط ایمنی زایی واکسن فوق مؤثر باشد.